Contents Menu Expand Light mode Dark mode Auto light/dark, in light mode Auto light/dark, in dark mode
mlmm-toolkit
mlmm-toolkit

Guides

  • Getting Started
  • Quickstart: mlmm all
  • Quickstart: mlmm scan with -s (YAML spec)
  • Quickstart: mlmm tsopt
  • Concepts & Workflow
  • Common Error Recipes
  • Troubleshooting
  • CLI Conventions
  • はじめに
  • クイックスタート: mlmm all
  • クイックスタート: mlmm scan + -s(YAML スペック)
  • クイックスタート: mlmm tsopt
  • 概念とワークフロー
  • 典型エラー別レシピ
  • トラブルシューティング
  • CLI 規約

Commands

  • all
  • extract
  • add-elem-info
  • mm-parm
  • define-layer
  • opt
  • tsopt
  • path-opt
  • path-search
  • scan
  • scan2d
  • scan3d
  • freq
  • irc
  • dft
  • trj2fig
  • oniom-export
  • oniom-import
  • fix-altloc
  • energy-diagram
  • Device Configuration & HPC Setup
  • Gaussian ONIOM Mode (oniom-export --mode g16)
  • ORCA QM/MM Mode (oniom-export --mode orca)
  • all
  • extract
  • add-elem-info
  • mm-parm
  • define-layer
  • opt
  • tsopt
  • path-opt
  • path-search
  • scan
  • scan2d
  • scan3d
  • freq
  • irc
  • dft
  • trj2fig
  • oniom-export
  • oniom-import
  • fix-altloc
  • energy-diagram
  • デバイス設定 & HPC セットアップ
  • Gaussian ONIOM モード(oniom-export --mode g16)
  • ORCA QM/MM モード(oniom-export --mode orca)

Reference

  • CLI Command Reference
    • mlmm add-elem-info
    • mlmm all
    • mlmm define-layer
    • mlmm dft
    • mlmm energy-diagram
    • mlmm extract
    • mlmm fix-altloc
    • mlmm freq
    • mlmm irc
    • mlmm mm-parm
    • mlmm oniom-export
    • mlmm oniom-import
    • mlmm opt
    • mlmm path-opt
    • mlmm path-search
    • mlmm pysis
    • mlmm scan
    • mlmm scan2d
    • mlmm scan3d
    • mlmm trj2fig
    • mlmm tsopt
  • YAML Schema
  • YAML Reference
  • ML/MM Calculator
  • Python API
  • mlmm pysis — pysisyphus YAML Workflows
  • Glossary
  • YAML 設定リファレンス
  • ML/MM 計算機
  • Python API
  • mlmm pysis — pysisyphus YAMLワークフロー
  • 用語集

Language

  • 日本語
    • はじめに
    • クイックスタート: mlmm all
    • クイックスタート: mlmm scan + -s(YAML スペック)
    • クイックスタート: mlmm tsopt
    • 概念とワークフロー
    • 典型エラー別レシピ
    • トラブルシューティング
    • CLI 規約
    • all
    • extract
    • add-elem-info
    • mm-parm
    • define-layer
    • opt
    • tsopt
    • path-opt
    • path-search
    • scan
    • scan2d
    • scan3d
    • freq
    • irc
    • dft
    • trj2fig
    • oniom-export
    • oniom-import
    • fix-altloc
    • energy-diagram
    • デバイス設定 & HPC セットアップ
    • Gaussian ONIOM モード(oniom-export --mode g16)
    • ORCA QM/MM モード(oniom-export --mode orca)
    • YAML 設定リファレンス
    • ML/MM 計算機
    • Python API
    • mlmm pysis — pysisyphus YAMLワークフロー
    • 用語集
Back to top
EN | JA
Copyright © 2025, Takuto Ohmura
Made with Sphinx and @pradyunsg's Furo